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BONIZZONI PAOLA
Foto di BONIZZONI PAOLA
Tel.: 02 6448 7814
paola.bonizzoni@unimib.it
BONIZZONI PAOLA
professore ordinario
Settore scientifico disciplinare:
Dottore di ricerca in:
Informatica, Università degli Studi di Milano
Dipartimento:
Edificio e stanza:
U14-2035
Per saperne di più: altri links
Corso di laurea in:
Informatica
Corso di laurea magistrale in:
Informatica
Dottorato in:
Informatica
Aree tematiche di ricerca:
  1. Bioinformatica: risoluzione con algoritmi esatti e approssimanti di problemi di ottimizzazione su sequenze ed alberi (filogenesi) riguardanti l'analisi e il confronto di sequenze biologiche (DNA, RNA). Algoritmi in memoria esterna per assemblaggio ed analisi (RNA-DNA) con tecnologie NGS.
  2. Inferenza di aplotipi, predizione genica e splicing alternativo, metodi di clusterizzazione per dati di analisi genica,  problemi di confronto e ricostruzione di alberi evoluzionari.
  3. Computazione molecolare: risultati ottenuti relativi al comportamento di modelli di calcolo molecolare descritti tramite un approccio metodologico proprio della teoria dei linguaggi formali.
  4. Informatica teorica: in particolare: teoria degli automi e linguaggi formali, teoria degli algoritmi (grafi e strutture relazionali), complessità computazionale, di approssimazione e bioinformatica.
Parole chiave:
Bioinformatica; Algoritmi
Keywords:
Bioinformatics; Algorithms
Pubblicazioni:
  • Beretta, S., Bonizzoni, P., Della Vedova, G., Pirola, Y., & Rizzi, R. (2014). Modeling Alternative Splicing Variants from RNA-Seq Data with Isoform Graphs. Journal of computational biology, 21(1), 16-40. - ISSN: 1066-5277 EISSN: 1557-8666
  • Alonso-Alemany, D., Barré, A., Beretta, S., Bonizzoni, P., Nikolski, M., & Valiente, G. (2013). Further Steps in TANGO: Improved Taxonomic Assignment in Metagenomics. Bioinformatics. - ISSN: 1367-4803 EISSN: 1367-4811
  • Castrignanò, T., D'Antonio, M., Anselmo, A., Carrabino, D., D'Onorio De Meo, A., D'Erchia, A.M., et al. (2008). ASPicDB: A database resource for alternative splicing analysis. Bioinformatics, 24(10), 1300-1304. - ISSN: 1367-4803
  • Bonizzoni, P., Della Vedova, G., Dondi, R., & Jiang, T. (2008). On the Approximation of Correlation Clustering and Consensus Clustering. Journal of computer and system sciences, 74(5), 671-696. - ISSN: 0022-0000
  • Bonizzoni, P., De Felice, C., & Zizza, R. (2005). The structure of reflexive regular splicing languages via Schuetzenberger constants. THEORETICAL COMPUTER SCIENCE, 334(1), 71-98. - ISSN: 0304-3975
Curriculum Vitæ
Curriculum non disponibile

  
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- ultimo aggiornamento di questa pagina 28/07/2014