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1. Data Web e Text Mining, sviluppo di metodi computazionali per l'analisi e la classificazione di dati numeri e dati non struttuti. Obiettivo generale di quest'area è lo sviluppo di sistemi di "content management" anche multimediali.
2. Bioinformatica: drug design, sviluppo di piattaforme informatiche ad alte prestazioni per Rational Drug Design, in particolare metodi di classificazione e regressione per screening virtuale e tossicologia predittiva.
3. Computationa Systems Biology: analisi di reti metaboliche con metodi di programmazione matematica.
4. Ambient Intelligence: sviluppo di metodi statistici di machine learning per l'analisi di attività e la identificazione di comportamenti anomali. Applicazioni al controllo del traffico, gestione delle emergenze e telemedicina.

• Lulli, G., Messina, V., Archetti, F.A., & Lanzeni, S. (2010). A mathematical model for optimal functional disruption of biochemical networks. Journal of mathematical modelling and algorithms, 9(1), 19-37. - ISSN: 1570-1166 EISSN: 1572-9214
• Archetti, F.A., Giordani, I., Messina, V., Maccagnola, D., Ogliari, G., & Mari, D. (2010). A model for cost effectiveness analysis of using genetic information of oral anticoagulation patients. In 2010 IEEE Workshop on Health Care Management (WHCM 2010). Institute of Electrical and Electronics Engineers ( IEEE ). - ISBN: 978-1-4244-4998-9
• Fersini, E., Messina, V., & Archetti, F.A. (2010). A probabilistic relational approach for web document clustering. Information processing & management, 46(2), 117-130. - ISSN: 0306-4573
• Toscani, D., Bargna, F., Quarenghi, L., Archetti, F.A., & Giordani, I. (2010). A software system for data integration and decision support for evaluation of air pollution health impact. In Proceedings of the 12th International Conference on Enterprise Information Systems. Volume 2,Artificial Intelligence and Decision Support Systems (pp.284-290). Joaquim Filipe and José Cordeiro. - ISBN: 978-989-8425-05-8
• Fersini, E., Messina, V., Arosio, G., & Archetti, F.A. (2010). Audio-Based Emotion Recognition in Judicial Domain: A Multilayer Support Vector Machines Approach. In MLDM 2009 (pp.594-602). - ISBN: 978-3-642-03069-7