Anno di corso: 1

Crediti: 8
Crediti: 8
Crediti: 8
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale

Anno di corso: 2

Anno di corso: 3

Crediti: 8
Crediti: 8
Crediti: 16
Tipo: A scelta dello studente
Crediti: 4
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 13
Tipo: Altro

ELEMENTI DI BIOINFORMATICA

Scheda dell'insegnamento

Anno accademico di regolamento: 
2014/2015
Anno di corso: 
3
Anno accademico di erogazione: 
2016/2017
Tipo di attività: 
Obbligatorio a scelta
Crediti: 
8
Ciclo: 
Primo Semestre
Ore di attivita' didattica: 
72
Prerequisiti: 

Algoritmi e strutture dati; Linguaggi di programmazione;

Moduli

Metodi di valutazione

Tipo di esame: 
Orale
Modalita' di verifica dell'apprendimento: 

La verifica dell'apprendimento comprende una prova scritta e una eventuale discussione del risultato
La verifica dell'apprendimento comprende la discussione di un progetto

Valutazione: 
Voto Finale

Obiettivi formativi

Alla fine del corso lo studente avrà compreso le principali problematiche computazionali e tecniche algoritmiche in bioinformatica.
Sarà in grado di scrivere programmi di modeste dimensioni per risolvere problemi in bioinformatica utilizzando anche dati presenti su basi di dati pubbliche

Contenuti

Principali problemi e algoritmi in bioinformatica. Pattern Matching. Allineamento di sequenze. Sequenziamento di DNA. Gestione di dati e basi di dati biologici

Programma esteso

1 Algoritmi e strutture dati per il pattern matching

2 Allineamento di sequenze

3 Sequenziamento di DNA

4 Formati di file di dati biologici

5 Banche dati biologiche

6 Metodologie di sviluppo software per la bioinformatica

Bibliografia consigliata

Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology.
Dan Gusfield.

Approfondimenti su materiale fornito dai docenti

Metodi didattici

Lezioni in aula e attività di laboratorio. Utilizzo della piattaforma di e-learning per integrare lo studio individuale tramite arricchimento delle attività in aula e per autovalutazioni in itinere del livello di preparazione ottenuto