Anno di corso: 1

Crediti: 8
Crediti: 8
Crediti: 8
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale
Crediti: 3
Tipo: Lingua/Prova Finale

Anno di corso: 2

Anno di corso: 3

ELEMENTI DI BIOINFORMATICA

Scheda dell'insegnamento

Anno accademico di regolamento: 
2015/2016
Anno di corso: 
3
Anno accademico di erogazione: 
2017/2018
Tipo di attività: 
Obbligatorio a scelta
Crediti: 
8
Ciclo: 
Primo Semestre
Ore di attivita' didattica: 
72
Prerequisiti: 

Algoritmi e strutture dati; Linguaggi di programmazione;

Moduli

Metodi di valutazione

Modalita' di verifica dell'apprendimento: 

La verifica dell'apprendimento comprende una prova scritta e una eventuale discussione del risultato La verifica dell'apprendimento comprende la discussione di un progetto

Valutazione: 
Voto Finale

Obiettivi formativi

Alla fine del corso lo studente avrà compreso le principali problematiche computazionali e tecniche algoritmiche in bioinformatica. Sarà in grado di scrivere programmi di modeste dimensioni per risolvere problemi in bioinformatica utilizzando anche dati presenti su basi di dati pubbliche

Contenuti

Principali problemi e algoritmi in bioinformatica. Pattern Matching. Allineamento di sequenze. Sequenziamento di DNA. Storie evolutive. Gestione di dati e basi di dati biologici

Programma esteso

1 Algoritmi e strutture dati per il pattern matching
2 Allineamento di sequenze
3 Sequenziamento di DNA
4 Alberi evolutivi
5 Formati di file di dati biologici
6 Banche dati biologiche
7 Metodologie di sviluppo software open source per la bioinformatica

Bibliografia consigliata

Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Dan Gusfield. Approfondimenti su materiale fornito dai docenti

Metodi didattici

Lezioni in aula e attività di laboratorio. Utilizzo della piattaforma di e-learning per integrare lo studio individuale tramite arricchimento delle attività in aula e per autovalutazioni in itinere del livello di preparazione ottenuto