Anno di corso: 1

Anno di corso: 2

Crediti: 6
Crediti: 6
Crediti: 6
Crediti: 2
Tipo: A scelta dello studente
Crediti: 4
Tipo: A scelta dello studente
Crediti: 6
Tipo: A scelta dello studente
Crediti: 16
Tipo: A scelta dello studente
Crediti: 23
Tipo: Lingua/Prova Finale

MICROBIOLOGIA AMBIENTALE

Scheda dell'insegnamento

Anno accademico di regolamento: 
2017/2018
Anno di corso: 
2
Anno accademico di erogazione: 
2018/2019
Tipo di attività: 
Obbligatorio a scelta
Lingua: 
Italiano
Crediti: 
6
Ciclo: 
Primo Semestre
Ore di attivita' didattica: 
47
Prerequisiti: 

Conoscenze di base di microbiologia

Moduli

Metodi di valutazione

Tipo di esame: 
Orale
Modalita' di verifica dell'apprendimento: 

Le conoscenze acquisite sui concetti di microbiologia ambientale applicati agli ambienti marini saranno verificate tramite un esame orale. Una relazione sulle attività di laboratorio consentirà di testare le competenze bioinformatiche applicate alla microbiologia ambientale.

Valutazione: 
Voto Finale

Obiettivi formativi

Competenze nella microbiologia applicata degli ambienti marini

Competenze nelle analisi molecolari e tradizionali per la caratterizzazione di comunità microbiche

Abilità nell'analisi dei dati dalla caratterizzazione della comunità microbica mediante strumenti bioinformatici

Contenuti

1. Metabolismi microbici e diversità negli ambienti marini: diversità di batteri e archea negli ambienti marini, diversità metabolica dei microbi negli ambienti marini

2. Ruolo dei microrganismi nei processi oceanici

3. Tecniche per la caratterizzazione di comunità microbiche in ambienti marini

4. Habitat microbici marini

5. Aspetti microbici delle problematiche ambientali negli ambienti marini

Programma esteso

1. Metabolismi microbici e diversità negli ambienti marini: diversità di batteri e archea negli ambienti marini, diversità metabolica dei microbi negli ambienti marini-

- Filogenesi molecolare microbica

- Fototrofia

- Respirazione microbica

- Principali microrganismi nell'ambiente marino

2. Ruolo dei microrganismi nei processi oceanici:

- Ciclo del carbonio

- Ciclo di zolfo

- Ciclo del ferro

3. Tecniche per la caratterizzazione di comunità microbiche in ambienti marini

- Marcatori filogenetici

- Librerie del gene 16S rRNA

- Metagenomica

- Analisi al microscopio

4. Habitat microbici marini

- Ambienti costieri

- Oceano aperto

- Cold seep

- Hydrothermal vents

5. Aspetti microbici delle problematiche ambientali negli ambienti marini:

- Biodegradazione aerobica e anaerobica di idrocarburi alifatici e aromatici

- Trattamenti biologici di sedimenti contaminati

6. Analisi bioinformatica dei dati metagenomici per la caratterizzazione delle comunità microbiche

Bibliografia consigliata

1. “Marine Microbiology: ecology and applications” (2011), 2nd edition di Colin Munn. GS, New York

2. “Bioremediation and Natural Attenuation” (2006) di P. J. J. Alvarez, W. A. Illman. Ed Wiley $ Sons, New Jersey

3. “Brock - Biology of Microorganisms” (2007) di M. T. Madigan, J. M. Martinko Brock. Ed. CEA Milano.

4. “Molecular Microbial Ecology”. Ed. A.M. Osborn, C. J. Smith (2005) Taylor & Francis Group – New York NY

Articoli scientifici forniti

Modalità di erogazione

Convenzionale

Metodi didattici

Lezioni, seminari: 5 crediti

Laboratorio bioinformatica: 1 credito