PROTEOMICA E METABOLOMICA

Scheda dell'insegnamento

Anno accademico di regolamento: 
2017/2018
Anno di corso: 
1
Anno accademico di erogazione: 
2017/2018
Tipo di attività: 
Obbligatorio
Crediti: 
6
Ciclo: 
Secondo Semestre
Ore di attivita' didattica: 
52
Prerequisiti: 

Conoscenze di base di chimica, biochimica e statistica

Moduli

Metodi di valutazione

Modalita' di verifica dell'apprendimento: 

Scritto - Orale

Valutazione: 
Voto Finale

Obiettivi formativi

Fornire allo studente le conoscenze sulle tecnologie di proteomica e metabolomica applicate a studi clinici.

Conoscenze di base di chimica, biochimica e statistica

Contenuti

Concetti di proteomica e metabolomica: strumentazioni e approcci analitici utilizzati nello studio del proteoma, dei processi metabolici e delle loro alterazioni per indagini biomediche.

Programma esteso

Definizione dei termini e delle caratteristiche delle tecniche analitiche cromatografiche per indagini quali- quantitative.
Conoscenze e nozioni della spettrometria di massa applicata alla proteomica e metabolomica.
Identificazione di proteine con la tecnica del “Peptide mass fingerprint”.
Spettrometria di massa accoppiata (MS/MS).
Interpretazione di spettri MS/MS di peptidi.
Identificazione delle proteine mediante approcci bottom-up e top-down.
Caratterizzazione di modificazioni post-traduzionali mediante spettrometria di massa.
Proteomica quantitativa: gel-free e gel-based; label-based e label-free.
Tecniche di “imaging” mediante spettrometria di massa e sue applicazioni: profiling e Imaging
Tecnologie analitiche di metabolomica .
Esempi di applicazioni in ricerche cliniche.

Bibliografia consigliata

Review e articoli pubblicati su riviste internazionali verranno indicati durante il corso.
Downard K., Mass spectrometry . A foundation course. Royal Society of Chemistry, 2004 ISBN 0-8504-609-7
Gary Siuzdak, Mass Spectrometry for Biotechnology, Academic Press 1996
Per consultazione:
J. H. Gross, Mass Spectrometry. A Textbook, Berlin – Heidelberg, Springer Verlag, 2004
E. De Hoffmann, V. Stroobant, Mass Spectrometry. Principles and Application, 2nd Edition Chichester, John Wiley & Sons, 2001.
C. Dass, Principles and Practice of Biological Mass Spectrometry, New York, Wiley-Interscience, 2000. ISBN 0471330531
Chapman, John R. Mass Spectrometry of Proteins and Peptides, Humana press 2000, ISBN 0-89603-609-X
Walker, John M. The Proteomics Protocols Handbook Humana Press, 2005

Metodi didattici

Lezioni frontali; Esercitazioni