BONIZZONI PAOLA

Ruolo:
Professoressa ordinaria
Settore scientifico disciplinare:
Informatica (INF/01)
Telefono:
Stanza:
  • U14, Piano: 2, Stanza: 2040

Pubblicazioni

  • Cozzi, D., Bonizzoni, P., Denti, L. (2023). ESGq: Alternative Splicing events quantification across conditions based on Event Splicing Graphs. In Proceedings of the 23rd Conference Information Technologies – Applications and Theory (ITAT 2023) (pp.242-249). CEUR-WS. Dettaglio

  • Bonizzoni, P., Della Vedova, G., Pirola, Y., Rizzi, R., Sgrò, M. (2023). Multiallelic Maximal Perfect Haplotype Blocks with Wildcards via PBWT. In Bioinformatics and Biomedical Engineering
    10th International Work-Conference, IWBBIO 2023, Meloneras, Gran Canaria, Spain, July 12–14, 2023, Proceedings, Part I (pp.62-76). Springer [10.1007/978-3-031-34953-9_5].
     Dettaglio

  • Bonizzoni, P., Boucher, C., Cozzi, D., Gagie, T., Köppl, D., Rossi, M. (2023). Data Structures for SMEM-Finding in the PBWT. In String Processing and Information Retrieval
    30th International Symposium, SPIRE 2023, Pisa, Italy, September 26–28, 2023, Proceedings (pp.89-101). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH [10.1007/978-3-031-43980-3_8].
     Dettaglio

  • Cozzi, D., Rossi, M., Rubinacci, S., Gagie, T., Köppl, D., Boucher, C., et al. (2023). μ-PBWT: a lightweight r-indexing of the PBWT for storing and querying UK Biobank data. BIOINFORMATICS, 39(9) [10.1093/bioinformatics/btad552]. Dettaglio

  • Denti, L., Khorsand, P., Bonizzoni, P., Hormozdiari, F., Chikhi, R. (2023). SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads. NATURE METHODS, 20(4), 550-558 [10.1038/s41592-022-01674-1]. Dettaglio

Progetti di ricerca

Forgenom
Anno: 2022
Bando: FAQC 2022 - seconda finestra
Enti finanziatori: Università degli Studi di MILANO-BICOCCA
PNRR per la Missione 4, componente 2 Investimento 1.1- Avviso 104/2022 | PINC, Pangenome INformatiCs: from Theory to Applications
Anno: 2022
Bando: Bando PRIN 2022
Enti finanziatori: MINISTERO DELL'UNIVERSITA' E DELLA RICERCA (MUR)
ALPACA-ALgorithms for PAngenome Computational Analysis
Anno: 2020
Bando: Innovative Training Networks
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
PANGAIA - Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration
Anno: 2019
Bando: Research and Innovation Staff Exchange
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
Modulation of anti-cancer immune response by regulatory non-coding RNAs
Anno: 2013
Bando: 2013-007 - Ricerca Scientifica in ambito biomedico, Ricerca scientifica in ambito biomedico
Enti finanziatori: FONDAZIONE CARIPLO

Premi e responsabilità scientifiche

Comitati editoriali

  • Direttore di rivista, collana editoriale, enciclopedia - THEORY AND APPLICATIONS OF COMPUTABILITY, 2010

Incarichi di insegnamento o ricerca

  • Visiting Researcher - ricercatore - University of California at Davis, 1998
  • Visiting Researcher - ricercatore - McMaster University, 1997
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1994
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1991 - 1992

Congressi/Convegni

  • Program chair - CiE2013. The Nature of Computation, 2013

Link di approfondimento