BONIZZONI PAOLA

Ruolo:
Professore ordinario
Settore scientifico disciplinare:
Informatica (INF/01)
Telefono:
Stanza:
  • U14, Piano: 2, Stanza: 2040

Pubblicazioni

  • Avila Cartes, J., Anand, S., Ciccolella, S., Bonizzoni, P., Della Vedova, G. (2023). Accurate and fast clade assignment via deep learning and frequency chaos game representation. GIGASCIENCE, 12 [10.1093/gigascience/giac119]. Dettaglio

  • Bonizzoni, P., De Felice, C., Pirola, Y., Rizzi, R., Zaccagnino, R., Zizza, R. (2022). Can Formal Languages Help Pangenomics to Represent and Analyze Multiple Genomes?. In Developments in Language Theory (pp.3-12). Cham : Springer [10.1007/978-3-031-05578-2_1]. Dettaglio

  • Baaijens, J., Bonizzoni, P., Boucher, C., Della Vedova, G., Pirola, Y., Rizzi, R., et al. (2022). Computational graph pangenomics: a tutorial on data structures and their applications. NATURAL COMPUTING, 21(1), 81-108 [10.1007/s11047-022-09882-6]. Dettaglio

  • Rossi, M., Oliva, M., Bonizzoni, P., Langmead, B., Gagie, T., Boucher, C. (2022). Finding Maximal Exact Matches Using the r-Index. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 29(2), 188-194 [10.1089/cmb.2021.0445]. Dettaglio

  • Bonizzoni, P., Petescia, A., Pirola, Y., Rizzi, R., Zaccagnino, R., Zizza, R. (2022). KFinger: Capturing Overlaps Between Long Reads by Using Lyndon Fingerprints. In Bioinformatics and Biomedical Engineering - 9th International Work-Conference, IWBBIO 2022, Maspalomas, Gran Canaria, Spain, June 27-30, 2022, Proceedings, Part II (pp.436-449). Cham : Springer Science and Business Media Deutschland GmbH [10.1007/978-3-031-07802-6_37]. Dettaglio

Progetti di ricerca

Forgenom
Anno: 2022
Bando: FAQC 2022 - seconda finestra
Enti finanziatori: Università degli Studi di MILANO-BICOCCA
ALPACA-ALgorithms for PAngenome Computational Analysis
Anno: 2020
Bando: Innovative Training Networks
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
PANGAIA - Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration
Anno: 2019
Bando: Research and Innovation Staff Exchange
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
Modulation of anti-cancer immune response by regulatory non-coding RNAs
Anno: 2013
Bando: 2013-007 - Ricerca Scientifica in ambito biomedico, Ricerca scientifica in ambito biomedico
Enti finanziatori: FONDAZIONE CARIPLO
Automi e Linguaggi Formali: Aspetti Matematici e Applicativi
Anno: 2011
Bando: 2011-120 - PRIN 2010-2011

Premi e responsabilità scientifiche

Comitati editoriali

  • Direttore di rivista, collana editoriale, enciclopedia - THEORY AND APPLICATIONS OF COMPUTABILITY, 2010

Incarichi di insegnamento o ricerca

  • Visiting Researcher - ricercatore - University of California at Davis, 1998
  • Visiting Researcher - ricercatore - McMaster University, 1997
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1994
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1991 - 1992

Congressi/Convegni

  • Program chair - CiE2013. The Nature of Computation, 2013

Link di approfondimento