Questo sito utilizza cookie tecnici, propri e di terze parti, per garantire la corretta navigazione e analizzare il traffico e, con il tuo consenso, cookie di profilazione e altri strumenti di tracciamento di terzi per mostrare video e misurare l'efficacia delle attività di comunicazione istituzionale. Puoi rifiutare i cookie non necessari e di profilazione cliccando su “Rifiuta tutti”. Puoi scegliere di acconsentirne l’utilizzo cliccando su “Accetta tutti” oppure puoi personalizzare le tue scelte cliccando su “Rivedi le tue scelte sui cookie”.

BONIZZONI PAOLA

Ruolo:
Professoressa ordinaria
Settore scientifico disciplinare:
Informatica (INFO-01/A)
Gruppo scientifico disciplinare:
INFORMATICA (01/INFO-01)
Telefono:
Stanza:
  • U14, Piano: 2, Stanza: 2040

Pubblicazioni

  • Ciccolella, S., Denti, L., Avila Cartes, J., Della Vedova, G., Pirola, Y., Rizzi, R., et al. (2025). Differential analysis of alternative splicing events in gene regions using residual neural networks. NEURAL COMPUTING & APPLICATIONS, 37(9), 6819-6829 [10.1007/s00521-025-10992-2]. Dettaglio

  • Bonizzoni, P., Boucher, C., Cozzi, D., Gagie, T., Pirola, Y. (2024). Solving the Minimal Positional Substring Cover Problem in Sublinear Space. In 35th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, CPM 2024. Schloss Dagstuhl- Leibniz-Zentrum fur Informatik GmbH, Dagstuhl Publishing [10.4230/LIPIcs.CPM.2024.12]. Dettaglio

  • Avila Cartes, J., Bonizzoni, P., Ciccolella, S., Della Vedova, G., Denti, L. (2024). PangeBlocks: customized construction of pangenome graphs via maximal blocks. BMC BIOINFORMATICS, 25(1) [10.1186/s12859-024-05958-5]. Dettaglio

  • Avila Cartes, J., Bonizzoni, P., Ciccolella, S., Della Vedova, G., Denti, L., Didelot, X., et al. (2024). RecGraph: recombination-aware alignment of sequences to variation graphs. BIOINFORMATICS, 40(5) [10.1093/bioinformatics/btae292]. Dettaglio

  • Bonizzoni, P., De Felice, C., Riccardi, B., Zaccagnino, R., Zizza, R. (2024). Unveiling the Connection Between the Lyndon Factorization and the Canonical Inverse Lyndon Factorization via a Border Property. In 49th International Symposium on Mathematical Foundations of Computer Science, MFCS 2024. Schloss Dagstuhl- Leibniz-Zentrum fur Informatik GmbH, Dagstuhl Publishing [10.4230/LIPIcs.MFCS.2024.31]. Dettaglio

Progetti di ricerca

Forgenom
Anno: 2022
Bando: FAQC 2022 - seconda finestra
Enti finanziatori: Università degli Studi di MILANO-BICOCCA
PNRR per la Missione 4, componente 2 Investimento 1.1- Avviso 104/2022 | PINC, Pangenome INformatiCs: from Theory to Applications
Anno: 2022
Bando: Bando PRIN 2022
Enti finanziatori: MINISTERO DELL'UNIVERSITA' E DELLA RICERCA (MUR)
ALPACA-ALgorithms for PAngenome Computational Analysis
Anno: 2020
Bando: Innovative Training Networks
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
PANGAIA - Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration
Anno: 2019
Bando: Research and Innovation Staff Exchange
Enti finanziatori: EUROPEAN COMMISSION
Modulation of anti-cancer immune response by regulatory non-coding RNAs
Anno: 2013
Bando: 2013-007 - Ricerca Scientifica in ambito biomedico, Ricerca scientifica in ambito biomedico
Enti finanziatori: FONDAZIONE CARIPLO

Premi e responsabilità scientifiche

Comitati editoriali

  • Direttore di rivista, collana editoriale, enciclopedia - THEORY AND APPLICATIONS OF COMPUTABILITY, 2010

Incarichi di insegnamento o ricerca

  • Visiting Researcher - ricercatore - University of California at Davis, 1998
  • Visiting Researcher - ricercatore - McMaster University, 1997
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1994
  • Visiting Researcher - ricercatore - University of Colorado Boulder, 1991 - 1992

Congressi/Convegni

  • Program chair - CiE2013. The Nature of Computation, 2013

Link di approfondimento