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DAMIANI CHIARA

Ruolo:
Professoressa associata
Settore scientifico disciplinare:
Informatica (INFO-01/A)
Gruppo scientifico disciplinare:
INFORMATICA (01/INFO-01)
Telefono:

Biografia

Ha ottenuto un dottorato in Modellistica, Simulazione Computazionale e Caratterizzazione Multiscala per le Scienze dei Materiali e della Vita nel 2011 dall’Università di Modena e Reggio Emilia. È stata visiting scientist nel gruppo di Stuart Kauffman all’Institute for Biocomplexity and Informatics dell’Università di Calgary. Ha lavorato come ricercatore post-doc al COSBI The Microsoft Research - University of Trento Centre for Computational e Systems Biology e in seguito al dipartimento di Informatica, Sistemistica e Comunicazione dell’Università di Milano Bicocca. È attualmente ricercatore a tempo determinato (tipo B) di Informatica al Dipartimento di Biotecnologie e Bioscienze dell’Università di Milano Bicocca. Ha svolto svariata attività didattica nell’ambito dell’insegnamento di informatica di base, bioinformatica e Systems Biology. È autore di oltre 40 pubblicazioni peer-reviewed. È associate editor per la rivista BMC Bioinformatics.

Pubblicazioni

  • Galuzzi, B., Milazzo, L., Damiani, C. (2024). Adjusting for false discoveries in constraint-based differential metabolic flux analysis. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 150(February 2024) [10.1016/j.jbi.2024.104597]. Dettaglio

  • Puniya, B., Verma, M., Damiani, C., Bakr, S., Drager, A. (2024). Perspectives on computational modeling of biological systems and the significance of the SysMod community. BIOINFORMATICS ADVANCES, 4(1) [10.1093/bioadv/vbae090]. Dettaglio

  • Galuzzi, B., Damiani, C. (2024). scFBApy: A Python Framework for Super-Network Flux Balance Analysis. In Artificial Life and Evolutionary Computation
    17th Italian Workshop, WIVACE 2023, Venice, Italy, September 6–8, 2023, Revised Selected Papers (pp.88-97). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH [10.1007/978-3-031-57430-6_8].
     Dettaglio

  • Ferrari, M., Lapi, F., Penati, L., Vanoni, M., Galuzzi, B., Damiani, C. (2024). Integrated visualization of metabolomics and transcriptomics with Galaxy. Intervento presentato a: 19th conference on Computational Intelligence methods for Bioinformatics and Biostatistics (CIBB), Benevento, Italia. Dettaglio

  • Galuzzi, B., Damiani, C. (2023). An Efficient Implementation of Flux Variability Analysis for Metabolic Networks. In Artificial Life and Evolutionary Computation - 16th Italian Workshop, WIVACE 2022, Gaeta, Italy, September 14–16, 2022, Revised Selected Papers (pp.58-69). Springer [10.1007/978-3-031-31183-3_5]. Dettaglio

Progetti di ricerca

PRIN 2022 PNRR- Missione 4, Componente 2, Investimento 1.1 - Avviso 1409/22 - EmbryoDiet: Sex-based predictions of dietary effects during gestation via multi-omics data integration of human embryo-like structures
Anno: 2022
Bando: Bando PRIN 2022
Enti finanziatori: M.I.U.R. - MINISTERO DELL'ISTRUZIONE, DELL'UNIVERSITA' E DELLA RICERCA

Premi e responsabilità scientifiche

Premi

  • Premio Giovani Talenti dell’Università degli Studi di Milano Bicocca, Università degli studi di Milano-Bicocca con il Patrocinio dell’Accademia Nazionale dei Lincei, 2016
  • best oral presentation a WIVACE 2016, steering committee of WIVACE 2016, Workshop on Artificial Life and Evolutionary Computation, 4-6 October 2016, Salerno, 2016
  • PREMIO GIOVANI TALENTI, Università degli Studi di Milano Bicocca con il patrocinio dell’Accademia Nazionale dei Lincei, 2016
  • BEST ORAL PRESENTATION AWARD, steering committee of WIVACE 2016, Workshop on Artificial Life and Evolutionary Computation, 4-6 October 2016, Salerno, 2016

Partecipazioni scientifiche

  • Componente del Consiglio/Comitato Direttivo - SysMod: Community of Special Interest in Computational Modelling of Biological Systems of the International Society of Systems Biology (ISCB) (Stati Uniti), 2022
  • Socio effettivo o corrispondente - Società Italiana di Bioinformatica (BITS) (Italia), 2018
  • Socio effettivo o corrispondente - International Society for Computational Biology ISCB (Stati Uniti), 2016 - 2018
  • Socio effettivo o corrispondente - Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare (Italia), 2015
  • Fellow - Infolife, 0

Comitati editoriali

  • Associate Editor di rivista o collana editoriale - BMC BIOINFORMATICS, 2019

Incarichi di insegnamento o ricerca

  • Professore a contratto - Docente a contratto del corso “omics Data integration” (20h) per il Master “qOmics: quantitative methods for Omics Data” - Università degli Studi di MILANO-BICOCCA, 2021
  • Professore a contratto - docente del corso “omics Data integration” del Master in Quantitative Omics - Università degli Studi di MILANO-BICOCCA, 2021
  • Professore a contratto - docente di un corso presso la scuola di dottorato Biomolecular Medecine dell'Università degli Studi di Verona - Università degli Studi di VERONA, 2021
  • Professore a contratto - docente di un corso presso la scuola di dottorato in “Biomolecular Medecine” dell'Universitá di Verona - Università degli Studi di VERONA, 2021

Congressi/Convegni

  • Program committee - LOD 2020, The Sixth International Conference on Machine Learning, Optimization, and Data Science – July 19-22, 2020 – Certosa di Pontignano, Siena – Tuscany, Italy(Italia), 2023
  • Program committee - 5th RECOMB Satellite Workshop on Computational Cancer Biology, April 14-15, 2023, Istanbul, Turkey(Turchia), 2023
  • Program committee - SAC 2020, The 35th ACM/SIGAPP Symposium On Applied Computing, March 30 – April 3, 2020(Regione non valida o sconosciuta), 2023
  • Program chair - ICSB 2022: The 21st International Conference On Systems Biology(Germania), 2022
  • Program committee - WIVACE 2022, XVI Workshop on Artificial Life and Evolutionary Computation, Gaeta (LT), Italy, September 14-16, 2022(Italia), 2022
  • Program committee - CIBB 2021, 17th International Conference on Computational Intelligence methods for Bioinformatics and Biostatistics, online on 15, 16, 17 November 2021., 2021
  • Program committee - LOD 2021, The 7th International Online & Onsite Conference on Machine Learning, Optimization, and Data Science – October 4 – 8, 2021 – Grasmere, Lake District, England – UK(Regno Unito), 2021