Attrezzature per la ricerca

Citofluorimetro Cell Lab

Cytoflex S è un citofluorimetro da banco, dotato di 3 linee laser e 9 canali di fluorescenza. Viene utilizzato principalmente per analisi qualitative e quantitative di parametri fisico-biologici in cellule di mammifero e lievito.
Caratteristiche tecniche specifiche
 Cytoflex S ha 3 laser e 9 canali di fluorescenza.
Nel dettaglio:
488nm laser blu filtri BP 525/40 - 690/50
561nm laser giallo-verde filtri BP 585/42 -610/20 – 690/50 – 780/60
638 nm laser rosso filtri BP 660/20 – 712/25 – 780/60

 Il software dedicato, Cytexpert, molto semplice nell’utilizzo, permette di lavorare con un range di 7 decadi dinamiche
 Il volume di campione analizzato va da un minimo di 10 μL ad un massimo di 240 μL al minuto
 Il sistema ottico permette la risoluzione di particelle fino a 300 nm
 Il laser 561 è estremamente efficiente nell’eccitazione delle proteine fluorescenti rosse (DsRed-mCherry)

Applicazioni principali
o Rilevamento ottimale di proteine fluorescenti
o Analisi DNA
o Vitalità cellulare
o Immunofenotipizzazione

Gas cromatografo in fase gassosa CLARUS 590 GC

Infrastruttura di calcolo parallelo ad alte prestazioni per Simulazioni computazionali

Analisi dati esperimento di fisica delle alte energie CMS (Compact Muon Solenoid) al Large Hadron Collider, CERN

Si tratta di un Cluster di calcolo HPC fornito da DELL italia consistente di 1 Headnode, 23 nodi di calcolo equipaggiati con 48CPU ciascuno e 2 nodi di calcolo equipaggiati con 48CPU e 2GPU, per un totale di 26 server di calcolo. La macchina include uno storage di 144+32Tb.

Cluster di calcolo ad alte prestazioni (HPC) basato su processori GPU di ultima generazione, ottimizzati per le elaborazioni nell’ambito dell’Intelligenza Artificiale.
Il cluster permette a tutti i membri del Dipartimento di avere accesso a una piattaforma di ricerca all’altezza dei più avanzati standard di ricerca e in particolare a:
- un nodo di accesso con elevate capacità di archiviazione dei dataset e dei risultati della ricerca (oltre 100 TeraByte)
- un software di gestione dell’accesso alle risorse basato su Slurm, standard nel campo della ricerca
- un nodo di calcolo dotato di 4 GPU Nvidia L40S (fino a 91,6 TFLOPS ciascuna) e 768 GB di memoria RAM

Il cluster è composto da macchine eterogenee che montano processori Intel e GPU NVIDIA di ultime generazioni. Grazie alla potenza di calcolo fornita soprattutto dalle GPU, queste macchine vengono utilizzate per l'addestramento di modelli di Machine Learning e Deep Learning per il supporto alla diagnosi, stratificazione del paziente e identificazione di terapie personalizzate per il paziente. Inoltre, grazie alla potenza di calcolo fornita dai processori, queste macchine vengono anche utilizzate per l'analisi di dati biomedicali, identificazione di potenziali nuovi biomarcatori per determinate patologie e neoplasie, e sviluppo di algoritmi per l'evoluzione di nuovi farmaci per patologie mirate. La natura del dato che queste macchine sono in grado di processare varia da dati di trascrittomica e genomica a dati di patologia digitale e spettrometria di massa.
I server sono stati configurati con distribuzioni linux server e sono manutenuti attivamente dai ricercatori del laboratorio. L’esecuzione di test e simulazioni scientifiche è gestita dallo strumento SLURM, in linea con le buone pratiche di gestione dei supercalcolatori del consorzio interuniversitario italiano (CINECA).

Simulazioni numeriche di QCD su reticolo;

Simulazioni numeriche di QCD su reticolo; esercitazioni didattiche per gli insegnamenti di Fisica Computazionale delle Lauree triennale e magistrale